青岛市疾病预防控制中心高通量基因测序仪(含 配套试剂耗材)采购需求

2021-09-17   机电产品招标投标电子交易平台

青岛市疾病预防控制中心高通量基因测序仪(含 配套试剂耗材)采购需求

一、项目概况及预算情况

1、项目概况:高通量基因测序仪(含配套试剂耗材)采购项目

2、本项目预算金额:本项目预算金额为 15400000.00 元。资

金来源:财政投资。

3、采购人信息:

名称:青岛市疾病预防控制中心

地址:青岛市山东路 175 号

联系方式:0532-85650290

二、采购需求

1.项目说明

1.1 本章内容是根据采购项目的实际需求制定的。

1.2 货物必须为合格产品,质量达到国家相关标准、行业标准、

地方标准或者其他标准、规范,中标人供货时应当提供有关货物的

合格证明材料等。

1.3 投标人应保证货物是全新、未使用过的合格产品。并完全符

合合同规定的质量、规格和性能的要求。中标人应保证所提供的货

物经正确安装、正常运转和保养后,在其使用寿命期内应具有满意

的性能。在货物质量保证期内卖方应对由于设计、工艺或者材料的

缺陷而发生的任何不足或者故障负责。所投产品应提供详细的技术

资料,应有检测报告等详细资料。

2

1.4 进口产品是指通过中国海关报关验放进入中国境内且产自

关境外的产品。

政府采购应当采购本国产品。采购人确需招标采购进口产品的,

应在招投标活动开始前,按照财政部《政府采购进口产品管理办法》

(财库〔2007〕119 号)文件规定办理审核手续,通过财政部门审核

后,方可招标采购进口产品,否则采购人不得招标采购进口产品,

投标人不得提供直接进口或者委托进口产品(包括已进入中国境内

的进口产品)。

采购人或采购代理机构在采购进口产品时不得拒绝国产相同质

量产品的制造商或代理商参与投标。

2.招标产品技术规格、要求和数量(包括附件、图纸等)

详见附录 1。

附录 1:

序号 货物名称 技术参数单位 数量 备注

1高通量基因测序仪详见“采购明细详细内容附件”序号 1-7项要求套 2

单价采购预算及最高限价 :¥ 570.01万元/台

2高通量基因测序仪配套详见“采购明细详细内容附批 1

采购预算及最高限

3试剂耗材 件”序号 8 项要求价 :¥ 399.98万元)

采购明细详细内容附件:

序号 设备参数要求

1 整体要求

1.1 设备用途:适用于新型冠状病毒肺炎、不明原因肺炎、

不明原因感染等突发和新发公共卫生事件的快速应对,

快速检测致病源;适用于微生物全基因组测序、全外显

子测序、转录组测序、全基因组小 RNA 测序、靶向测序、

微生物宏基因组分析、病毒基因组变异研究、甲基化研

究等。

1.2 满足自动化、高通量测序需求。

2 技术参数

★2.1 数据通量:主机测序每次反应测序数据产出量最高可达

300Gb。

2.2 高通量测序平台数据读取模式:单端读取序列和双端读

取序列。

2.3 测序原理:采用光学原理的基于可逆终止子边合成边测

序技术,使用荧光信号确认碱基种类,每次只读取一个

4

碱基,保证最终的核酸序列质量。

2.4 新冠捕获技术原理:采用多重 PCR 技术获得新冠病毒的

基因组全长,获得产物直接用于二代和三代基因组测序,

分析新冠病毒全长。

2.5 适用的样本类型:鼻咽拭子、灌洗液、胸积水、脑脊液、

全血、血清、血浆、尿液、粪便、石蜡包埋蜡块、纯培

养的细菌、病毒和寄生虫、环境标本等。

2.6 新冠全基因组序列采用 PCR 技术,全部捕获需不超过 3

小时完成。

2.7 提供未知病原检测 RNA 建库方案,RNA 起始量≦500pg;

提供基于酶切的 DNA 文库制备方案,时间小于 4 小时,DNA

起始量≦1 ng。

2.8 平台数据读长:单端读取序列,读长至少包括 50bp、100bp

和 150bp;双端读取序列,读长至少包括 2×50bp、

2×100bp 和 2×150bp。

2.9 读长 2×100 bp 时,整个测序运行完成时间≤21 小时。

2.10 读长 2×150 bp 时,整个测序运行完成时间≤29 小时。

2.11 不同样品并行性:提供≥380 个样品的 index(条码)混

合接头。

2.12 样本和芯片加载便利性:无需任何样本加载系统、无需

任何装载系统。

2.13 实验过程生物安全性:整个设备实验过程封闭,无人员

5

接触,无废液、废气外排。

★2.14 检测突变频率低于 0.1%。

2.15 测序数据准确性:测序结果给出严格的 Q30 质量数据,

当 2×150bp 测序时,Q30 值≥75%。

★2.16 全基因组测序覆盖度(coverage)≥99%。

2.17 测序过程中标签跳跃(Index Hopping)现象≤0.0001%。

2.18 测序结束后,不需进行液流流路的冲洗维护,操作简便,

节省操作者工作时间。

2.19 测序系统主机内置服务器,提供同品牌整合在测序仪内

的 App 版本优化的生物信息学分析软件。

2.20 测序仪内置生物信息分析加速器,提供准确的超快速基

因组分析功能,操作系统安全稳定。

3 生物信息分析系统

3.1 新冠病毒全基因组分析软件模块

3.1.1 可对主流的二代测序平台和三代测序平台产生的测序结

果进行新冠病毒全基因组序列分析,具备自动完成新冠

病毒全基因组序列拼接等功能。

3.1.2 图形化操作界面,无需命令行输入,从下机数据到结果

报告仅需一键式操作;下机数据自动生成病毒基因组溯

源进化树;用户可以自主添加序列信息,从而生成新的

进化树。

★ 实现 96 个样本的批量处理,可对接最新测序平台。

6

3.1.3

3.2 流感病毒基因组分析模块

3.2.1 从下机数据到结果报告仅需一键式操作。

3.2.2 实现 96 个样本的批量处理,完美对接新一代测序平台。

3.2.3 直接识别流感病毒关键位点的变异,区分不同亚型。

3.3 未知病原体高通量测序分析软件模块

3.3.1 可兼容二代测序和三代测序的下机数据;从下机数据到

结果报告仅需一键式操作。

3.3.2 分析 2GB 大小的测序数据 1h 内完成分析。

3.3.3 数据库包含≥8000 种病毒,≥9000 种支原体和细菌,

≥1000 种真菌和寄生虫。

3.3.4 提供结果数据的 reads 数目做图统计功能,相对 reads

做图统计功能,物种树分析功能;提供结果报告图片和

病原拼接序列结果的导出功能,用于未知病原体鉴定。

3.3.5 内含≥300 种常见病原注释信息,并且用户可自定义加

入病原,用于常见病原的识别。

3.4 宏基因组病原鉴定、抗性基因和毒力基因分析软件模块:

可进行毒力基因和耐药基因的鉴定功能,包含 KEGG、VFDB

在内的多个数据库。

3.5 细菌全基因组拼接和鉴定软件模块

3.5.1 具备细菌全基因组拼接功能;可进行进化树分析。

3.5.2 可进行毒力基因和耐药基因的鉴定功能,包含 KEGG、VFDB

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在内的多个数据库。

3.6 数据分析服务器:处理器;内存≥64GB,2400MTs;硬盘

≥16TB 7.2K RPM SATA 6Gb/S;配置有线鼠标和键盘,

16X DVD-ROM SATA 光驱;显示器≥27 英寸。

3.7 处理器 CPU≥十四核二十八线 1.7 GHZ。

4 高通量测序平台数据分析系统

4.1 操作系统:支持 windows、Mac 或 linux 三种操作系统

之一。

4.2 操作界面:可视化操作窗口,无需命令行编程经验,不

需要编写 linux 命令。

4.3 数据识别:支持不同测序平台的数据导入和分析,包括

一代测序数据 Sanger 平台;二代测序平台数据,如

SOLID 、 Life Ion Torrent 、 Complete Genomics 、

Roche454、Illumina Genome Analyzer;三代测序数据,

如 PacBio 平台。

4.4 信息接口:提供下载 Hg19 或 Hg38 及其他生物的参考序

列及注释信息的接口。

4.5 分析流程:支持创建和修改 workflow,实现拓展或自定

义分析流程。

4.6 功能模块:可以进行 DNA-seq、RNA-seq、Chip-Seq、

Bisulfite、miRNA、Microarray、16S/宏基因组序列拼

接组装、SNP 检测、多样本分析、数字基因表达、小 RNA

8

分析、标签表达谱、表观基因组学分析、EST 文库构建、

系统发育分析、聚类分析等数据分析以及服务器整合和

定制化服务。可实现传统分子生物学分析工具的功能,

如从头组装、引物设计、序列比对、SNP 分型、系统发

育树分析、聚类分析等。

4.7 结果展示:可以创建 Genome Browser Track,可视化查

看分析结果。可以监控、暂停和终止分析过程、记录分

析日志。

4.8 微生物插件:配备微生物 Microbial Genomics Module

插件和 Genome Finishing Module 插件,实现宏因组、

微生物组靶标序列和全基因组的多样性、功能及分型研

究。软件及插件可实现每季度进行更新。

4.9 批量工作:支持批量上传和批量分析数据。

4.10 软件更新和维护:软件基于云端,包含大于六百六十万

条来自私有数据库、公共数据库和文献的记录,每季度

进行数据库和功能的更新。

4.11 分析功能:经典通路富集;上游调控因子;因果关系网

络分析;BioProfiler; 构建调控机理网络;分子活性预

测;相互作用网络;匹配分析;磷酸化调控分析;microRNA

靶标过滤;转录本分析;比较分析。

4.12 搜索功能:可以基于基因、化合物、通路、疾病、功能

对数据库进行插叙;图片处理:可以对通路图,基因,

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化合物,细胞结构等进行颜色、字体等调整;导出功能:

可以到处数据、表格、图片、通路图。

4.13 免费维护 5 年。

4.14 数据分析服务器:处理器至少 CPU 十四核二十八线 1.7

GHZ;内存≥64GB,2400MTs;硬盘≥12TB 7.2K RPM SATA

6Gb/S;配置有线鼠标和键盘,16X DVD-ROM SATA 光驱;

显示器≥27 英寸;

5 荧光定量 PCR 仪

5.

1

通道数:6 色激发光滤光片和 6 色检测光滤光片可

自由组合,最多检测 21 种不同的荧光光谱。

5.2 模块规格:支持 4 种模块,标准 96 孔模块;快速 96 孔

模块;384 孔模块;微流体芯片模块;模块可自行更换。

5.3 支持耗材:国际标准 96 孔 (0.2 mL) 反应板与光学盖膜,

0.2 mL 八连管,0.2mL 单管;384 孔反应板与光学盖膜,

微流体芯片。

5.4 温控模块最大变温速率:≥9.0°C/秒;样本最大变温速

率≥4.8℃/秒;

5.5 光学系统:高亮度白光 LED 光源 (寿命>5 年),6 色激发

滤光片,6 色检测滤光片、CMOS 成像;

5.6 精确数码温控模块: 6 个独立的精确数码温控区域,可

以同时实现 24 个可以独立的精确控温的温度设置;

5.7 被动参照染料:软件支持 Rox 荧光校正去除移液误差;

1

5.8 数据同时采集:所有反应孔同时采集荧光数据,不同孔

之间不存在时间差;

5.9 人脸识别:支持人脸识别功能,自动登入个人账户;

5.10 RFID 射频识别反应板:RFID 智能识别微流体芯片;

5.11 内置触摸屏电脑,触摸屏电脑可备份还原超过 300 次的

实验数据;仪器触摸屏提供一键式的实验方案,可快速

地设置多种应用。

6 PCR 热循环仪

6.1 最大模块变温速率:≥6.0℃/秒;最大样本变温速率:

≥4.4℃/秒

6.2 温度范围:0-100.0℃;

6.3 ≥6 组独立控温区域,可精确设置 6 个不同温度

6.4 支持区间温差最大 5℃,整体 25℃;允许区间最大 10℃,

整体 30℃;

6.5 以太网或 Wi-Fi 连接网络;

6.6 联机操控:无需购买软件,允许多台机器在同一局域网

内相互连接,并设置由其中一台来操控;

6.7 采用配套的控制软件,可以集中管理和控制多台不同型

号 PCR 仪;

6.8 内置模拟模式,可模拟主流 PCR 仪热学性能。

7 每套仪器配置要求

7.1 满足招标参数的基因测序仪主机:1 台;

1

7.2 满足招标参数的测序仪内置操作软件和内置数据分析软

件:1 套;

7.3 96 孔板离心机:1 台;

7.4 满足招标参数的流感病毒生物信息分析模块:1 套;

7.5 满足招标参数的未知病原分析模块:1 套;

7.6 满足招标参数的数据分析服务器:2 套;

7.7 满足招标参数的新冠病毒序列分析模块:1 套;

7.8 满足招标参数的细菌 16S 真菌 18S 全长鉴定和分析软件:

1 套;

7.9 满足招标参数的毒力基因和耐药基因分析软件:1 套;

7.10 满足招标参数的细菌全基因组拼接和鉴定分析软件:1

套;

7.11 满足招标参数的高通量测序平台数据分析系统:1 套;

7.12 核酸定量分析仪(含定量试剂 2 套):1 台;

7.13 96 孔板振荡器:1 台;

7.14 96 孔板磁力架:1 台(含 5 套深孔板);

7.15 1.5–2 mL 微量离心管适配 16 孔磁力架:1 台;

7.16 新型冠状病毒全基因组捕获、建库、标签、测序等试剂:

1 套;

7.17 满足全基因组测序工作需要的荧光定量 PCR 仪:1 台;

7.18 满足全基因组测序工作需要的 PCR 热循环仪:1 台;

7.19 数据信息储存系统:2 台

1

8 投标人所投高通量基因测序仪配套试剂耗材(采购预算

及最高限价:¥399.98 万元)

8.1 适用性:用于新型冠状病毒全基因组的扩增捕获、高通

量测序的建库及高通量测序实验,能够准确发现新的变

异、新的毒株,追踪病毒变异情况;

8.2 捕获试剂

8.2.1 灵敏度:仅需少量 RNA(<0.5ng);

8.2.2 适合 CT 值≤33 的新冠样本全基因组捕获,捕获效率≥

99%;

8.2.3 试剂盒搭配同品牌软件分析,可自动扣除扩增引物序列,

从而鉴定突变位点,识别突变株;

8.3 建库试剂

8.3.1 能够用于以上新冠捕获产物的建库,建库质量稳定,操

作简单;

8.3.2 标签数量≥96 种,与测序平台配套;

8.4 测序试剂

8.4.1 测序试剂盒测序读长:2*150bp;

8.4.2 数据产出:至少 120G 的数据产出;

8.4.3 质量分值:Q30≥75%;

8.4.4 适用机型:配套测序平台使用。

★8.5 数量要求

8.5.1 测序仪配套新冠病毒全基因组测序上机前试剂,1530 人

1

8.5.2 测序仪配套上机试剂盒,3038 人份

3.商务条件

★3.1 交货期

合同签订后 20 日内交货并安装调试完毕。

3.2 交货地点

招标人指定地点。

★3.3 付款方式

合同签订后,进场验收且财政资金到位后,预付预算金额的 30%

(¥462 万元),安装调试、验收合格后,中标人向招标人支付合同

金额的 10%作为质保金并向招标人开具合同金额 100%的发票,招标

人自收到发票之日起 5 个工作日付款至合同金额的 100%,质保金待

质保期满后无质量问题一次性无息付清。

3.4 验收

3.4.1 货物运抵现场后,采购人将对货物数量、质量、规格等进

行检验。如发现货物和规格或者两者都与招标文件、投标文件、合

同不符,采购人有权限根据检验结果要求中标人立即更换或者提出

索赔要求。

3.4.2 货物由中标人进行安装,完毕后,采购人应对货物的数量、

质量、规格、性能等进行详细而全面的检验。并提供装订成册的中

文使用说明书、操作手册等资料,验收 7 日后,证明货物质量无任

何问题,由采购人组成的验收小组签署验收报告,作为付款凭据之

1

一。

3.5 质量保证期

★3.5.1 设备质保期:自验收合格之日起 1 年,国家主管部门或

者行业标准对货物本身有更高要求的,从其规定并在合同中约定,

投标人亦可提报更长的质保期。

★3.5.2 配套试剂耗材有效期:自验收合格之日起配套试剂耗材

有效期≥6 个月。

3.5.3 质量保证期及配套试剂耗材有效期内,如果证实货物是有

缺陷的,包括潜在的缺陷或者使用不符合要求的材料等,中标人应

立即免费维修或者更换有缺陷的货物或者部件,保证达到合同规定

的技术以及性能要求。如果中标人在收到通知后 5 天内没有弥补缺

陷,采购人可自行采取必要的补救措施,但风险和费用由中标人承

担,采购人同时保留通过法律途径进行索赔的权利。

3.6 售后服务

3.6.1 中标人应提供及时周到的售后服务,应保证每季度至少一

次上门回访、检修。

3.6.2 中标人在接采购人通知 1 小时做出响应,6 小时内到达现

场,24 小时内维修完毕,不能在规定时间内修好的要免费提供备品

(机)备件。

★3.6.3 配套试剂耗材有效期满 60 日前,中标人免费为招标人

更换同品牌型号的最新批次试剂耗材。

3.6.4 中标人免费为采购人提供中文操作手册并培训操作人员,

1

其中包括讲解产品的结构以及原理、产品的使用以及维护保养,直

至操作人员能够独立的操作使用。

三、政府采购相关政策

1.《财政部国家发展改革委关于印发〈节能产品政府采购实施

意见〉的通知》(财库〔2004〕185 号);

2.《国务院办公厅关于建立政府强制采购节能产品制度的通知》

(国办发〔2007〕51 号);

3.《财政部环保总局关于环境标志产品政府采购实施的意见》

(财库〔2006〕90 号);

4.《政府采购促进中小企业发展管理办法》(财库〔2020〕46

号);《财政部司法部关于政府采购支持监狱企业发展有关问题的

通知》(财库〔2014〕68 号);

5.《关于促进残疾人就业政府采购政策的通知》财库[2017]141

号;

6.其他政府采购制度办法。

四、公示时间

本项目采购需求公示期限为3日历天。

五、意见反馈方式

本项目采购需求方案公示期间接受社会公众及潜在供应商的监

督。

请遵循客观、公正的原则,对本项目需求方案提出意见或者建

议,并请于采购需求公示期限结束前将书面意见反馈至采购人或者

1

采购代理机构,采购人或者采购代理机构应当于公示期满5个工作日

内予以处理。

采购人或者采购代理机构未在规定时间内处理或者对处理意见

不满意的,异议供应商可就有关问题通过采购文件向采购人或者采

购代理机构提出质疑;质疑未在规定时间内得到答复或着对答复不

满意的,异议供应商可以向采购人或同级财政部门提出投诉。

六、采购需求最终以发布的招标公告、招标文件为准。